Es posible acceder a todas las funciones del escritorio de GNOME a través de los menús. Los paneles contienen menús, y por tanto, es posible utilizar una combinación de menús y paneles para realizar tareas.
Están disponibles los siguientes menús:
Menú Aplicaciones: va acompañado con el logotipo de MoLinux. Es el menú que sirve para acceder a las principales aplicaciones del sistema, agrupadas por categorías. La última opción, , abre una aplicación que permite añadir aplicaciones que no se hayan instalado de forma automática con el sistema, así como quitar las aplicaciones instaladas que ya no nos interesen.
Menú Lugares: Permite el acceso directo a carpetas importantes como la Carpeta personal o el Escritorio, a las unidades del Equipo (disco duro, unidades de CD o DVD) y a los Servidores de red que puedan estar configurados. También se accede a una aplicación que permite buscar archivos en el equipo y a una lista de los documentos reciente.
: contiene acceso a herramientas de configuración, administración y ayuda.
Menú de Escritorio: es un menú contextual al que se accede pulsando el botón derecho del ratón sobre el escritorio. Desde dicho menú se puede crear un lanzador, crear una carpeta, cambiar algunas propiedades, etc...